Nøgleord

COVID-19; Coronavirus; SARS-CoVs; MERS-CoV

Introduktion

COVID-19 er en lungebetændelseslignende sygdom. Den er forårsaget af et nyt coronavirus ved navn SARS-CoV-2, som ligner SARS-virus (SevereAcute Respiratory Syndrome).

Den indbyrdes forbundethed i hele verden har været en fordel for SARS-CoV-2. Uden fly, tog og biler ville viruset ikke have nået så langt og hurtigt. Tværtimod kan sammenkoblingen også blive dens undergang. For videnskabsfolk over hele verden fokuserer på dens genom og de 27 proteiner, som den vides at producere, og uddyber gradvist deres forståelse og finder måder at stoppe den i dens spor.

Anatomi af COVID-19

I begyndelsen blev den nye virus kaldt 2019-nCoV. Senere kaldte forskerne i International Committee on Taxonomy ofViruses (ICTV) den for SARS-CoV-2 virus, da det er blevet konstateret, at den ligner den virus, der forårsagede SARS-udbruddet (SARS-CoVs).

CoVs er blevet de vigtigste mikroorganismer i forbindelse med luftvejsinfektioner. CoV’er er en stor familie af enkeltstrengedeRNA-virus (+ssRNA), som kan isoleres hos forskellige dyrearter. De kan forårsage sygdom hos mennesker lige fra almindelig forkølelse til mere alvorlige sygdomme som MERS og SARS.SARS er højst sandsynligt opstået fra flagermus og har derefter bevæget sig til andre værter hos pattedyr, f.eks.

Etiologi COVID-19

CoV’er er positivt-strengede RNA-virus med en kronelignende struktur, når de observeres i elektronmikroskop, på grund af tilstedeværelsen af spike-glykoproteiner på envelopen. Der findes fire hovedkategorier af coronavirus: Alphacoronavirus (α-CoV), Betacoronavirus (β-CoV), Deltacoronavirus (-CoV) og Gammacoronavirus (ƴ-CoV). Kun α & β-coronavirus er i stand til atinficere pattedyr/mennesker, og ved genomisk karakterisering blev det afsløret, at flagermus og gnavere er genkilderne til α-CoV og β-CoV. Fuglearter viser sig at være genkilder til δ-CoV’er og ƴ-CoV’er, og de har tendens til at inficere fugle.

7 humane coronavirusser (HCoV’er) er blevet identificeret indtil nu: HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV(forårsager alvorligt akut respiratorisk syndrom), MERS-CoV(Mellemøstligt respiratorisk syndrom) og nu SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 tilhører kategorien β-CoV’er. Det er generelt af rund/elliptisk eller pleomorfisk form med en diameter ≈ 60-140 nm. Det er også følsomt over for UV-lys og varme ligesom andre CoV’er. inaktiveringstemperaturen for SARS-CoV-2 er ca. 27° C. Det kan derimod også modstå kulde under 0° C. Endvidere kan den inaktiveres af lipidopløsningsmidler som ether (75 %), ethanol, klorholdige desinfektionsmidler, peroxyeddikesyre og kloroform, bortset fra klorhexidin.

Det blev opdaget, at genomsekvensen af SARS-CoV-2 er 96,2 % identisk med en flagermus-CoV RaTG13, mens den har79,5 % identitet med SARS-CoV. På grundlag af resultaterne af denne virusgenomsekventering & af den evolutionære analyse mistænkes flagermus for at være en naturlig vært for denne virusoprindelse, og SARS-CoV-2 kan være blevet overført fra flagermus via ukendte mellemværter til at inficere mennesker.

Coronavirus Genetik

Coronavirus, dette navn er blevet opfundet, da det ligner haloer (kendt som coronas) under elektronmikroskopet.Coronavirus er en stor familie af RNA-virus. Et typisk generisk coronavirusgenom er en enkelt RNA-streng, som er 32 kilobaser lang, og er kendt for at være det største RNA-virusgenom. Disse virus rekombinerer med en højere frekvens end alle andre positive RNA-virusstrenge, idet de ønsker at konsolidere genetisk information fra forskellige kilder, når en vært bliver inficeret med flere coronavirus. Coronavirusser muterer og ændrer sig med andre ord med høj hastighed, hvilket resulterer i et problem for både diagnostisk påvisning og behandlings- (og vaccine)regimer.

Coronavirus har en meget usædvanlig replikationsproces, der involverer en 2-trins replikationsmekanisme. Nogle få RNA-virusgenomer indeholder en enkelt åben læseramme (ORF), som derefter oversættes som et enkelt polyprotein, og dette polyprotein spaltes katalytisk i mindre funktionelle virale proteiner. Men coronavirusser indeholder op til 10 individuelle ORF’er. De flesteribosomer oversætter den største af disse ORF’er, kaldetreplicase, som alene svarer til dobbelt så stor som andreRNA-viralgenomer. Dette replicase-gen koder for en række enzymer, der udnytter det resterende genom som skabelon til at producere en kombination af mindre, overlappende messenger RNAmolekyler, som oversættes yderligere til strukturelle proteiner (byggestenene i nye virale partikler).