De seneste årtier har været vidne til en hidtil uset vækst i anvendelsen af probiotika til fremme af den generelle tarmsundhed samt deres indtræden som bioterapeutiske midler til at lindre visse kliniske lidelser relateret til dysbiose. Selv om talrige undersøgelser har underbygget de sundhedsfremmende potentialer for en begrænset gruppe af mikrobielle arter, synes den markedsførte ekstrapolering af en lignende probiotisk mærkning til et stort antal delvist karakteriserede mikrobielle formuleringer at være forudindtaget. Især personer under neonatale stadier og/eller personer med visse kliniske tilstande, herunder maligniteter, utætte tarme, diabetes mellitus og rekonvalescens efter organtransplantation, vil sandsynligvis ikke kunne høste fordelene ved probiotika. For at forværre forholdene yderligere kan nogle probiotiske stammer drage fordel af den svage immunitet i disse sårbare grupper og blive til opportunistiske patogener, der kan give anledning til livstruende lungebetændelse, endokarditis og sepsis. Desuden indebærer den uregulerede og udbredte brug af probiotika potentielt en risiko for plasmidmedieret overførsel af antibiotikaresistens til de infektiøse patogener i tarmene. I denne gennemgang diskuterer vi sikkerhedsperspektiverne for probiotika og deres terapeutiske indgreb i visse risikogrupper i befolkningen. De indarbejdede argumenter og hypoteser vil helt sikkert kaste lys over, hvorfor brugen af probiotika bør behandles med forsigtighed.