Ich habe nur begrenzte Erfahrung, da ich erst zum zweiten Mal spiele, aber bisher habe ich Folgendes beobachtet –
Wenn man sich den Minutemen anschließt, verbündet man sich mit der Eisenbahn und wird die Bruderschaft aus Stahl und das Institut zerstören.
Außerdem, wenn du die Minutemen-Missionen durchgespielt hast (bis einschließlich der Rückeroberung des Schlosses), dann werden während der Mission, in der das Institut versucht, Wallace „einzuladen“, ihrem Biowissenschaftsteam beizutreten, die Minutemen auf Wallaces Notruf antworten (was dir die Möglichkeit gibt, es ihnen auszureden). Wenn Sie sich den Minutemen nicht angeschlossen haben, werden die Gunners auf Wallace‘ Hilferuf reagieren. Im Verlauf der Minutemen-Story werden außerdem zahlreiche Gruppen umherziehender Minutemen in der Einöde patrouillieren und Artillerie freischalten.
Wenn du dich der Bruderschaft aus Stahl anschließt, erklärst du dem Institut und der Eisenbahn den Krieg und bist gleichzeitig mit den Minutemen verbündet.
Wenn du der Eisenbahn beitrittst, wirst du mit den Minutemen verbündet sein und die Bruderschaft aus Stahl und das Institut zerstören.
Wenn du dich dem Institut anschließt, bist du mit den Minutemen verbündet und zerstörst die Eisenbahn und die Bruderschaft aus Stahl.
Nachdem du die Storyline als Verbündeter des Instituts abgeschlossen hast, tauchen überall im Commonwealth Gruppen von Synths auf, die verkünden, dass das Institut jetzt das Sagen hat – sie stellen auch eine Reihe von Kontrollpunkten auf und streifen durch die Einöde, um Mutanten und Raider zu töten. Die verschiedenen Gefährten, die ich während meines Durchspielens benutzt habe, hatten nichts dagegen, dass ich mich auf die Seite des Instituts geschlagen habe, aber ich vermute, dass Deacon und Danse das vielleicht tun werden (da du ihre Fraktionen zerstört hast).
Unabhängig davon, welche Wahl du triffst,
„Vater“ wird sterben, aber die Zwischensequenz wird anders aussehen, wenn du nicht mit dem Institut verbündet bist. Wenn du das Institut angreifst, verlierst du es als Schnellreiseort. Alle Fraktionen, die ihr auslöscht, stehen nach der letzten Zwischensequenz nicht mehr für Missionen zur Verfügung.