I criminali di Gotham City hanno paura, perché Batman tiene al sicuro i buoni cittadini di Gotham. Il film si apre con una banda di uomini che indossano maschere da clown che irrompono nella banca dove la mafia tiene gran parte del suo denaro. La mente del colpo è qualcuno chiamato Joker. Alla fine del colpo, Joker arriva e mette una granata in bocca al direttore della banca.

Inconsapevoli della presenza di Joker nella loro città, Batman e il nuovo procuratore distrettuale, Harvey Dent, lavorano insieme al tenente Gordon per mettere fuori gioco una volta per tutte l’ultima impresa di riciclaggio di denaro della mafia. Credono di aver fermato definitivamente il riciclaggio e il crimine in città, fino a quando Joker si presenta per seminare il caos. Joker assassina un giudice, piazza una bomba in un ospedale e lo fa saltare in aria, e comincia a far fuori gli innocenti di Gotham uno dopo l’altro, finché Batman non rivela la sua identità.

Batman è determinato a combattere contro Joker. Per un po’ sembra che abbia il sopravvento, finché la sua migliore amica Rachel, che è anche la ragazza di Harvey Dent, viene uccisa nel fuoco incrociato. Quando metà della faccia di Harvey Dent viene bruciata in un’esplosione, il Joker lo porta al lato oscuro, incoraggiandolo a cercare vendetta per la morte di Rachel. Harvey adotta un nuovo nome, Due Facce, e Batman si ritrova con due pazzi da affrontare mentre la distruzione di Gotham incombe.

Il Joker ha chiaramente pianificato la sua conquista di Gotham per un bel po’ di tempo, e sembra essere almeno due passi avanti a Batman ad ogni passo. Dopo aver rilasciato una minaccia per l’intera città di Gotham, requisisce due traghetti e ne riempie uno di cittadini e uno di criminali condannati. Riempie inoltre entrambi i traghetti di esplosivi. Dà ad ogni barca un detonatore principale che farà esplodere l’altro traghetto. Se nessuno fa esplodere l’altra barca entro mezzanotte, dice, farà saltare in aria entrambe le barche. Alla fine Batman è in grado di sottomettere il clown malvagio e nessuno dei passeggeri dei traghetti viene ferito.

Harvey è ancora dalla parte di Joker, cosa che Batman non ha capito nella sua fretta di abbattere Joker stesso. Mentre Batman affronta Joker, Gordon viene a sapere che la sua famiglia è stata presa in ostaggio da Due Facce. Quando Gordon va a salvarli, Due Facce butta Gordon a terra, poi afferra il suo bambino, Jimmy, progettando di lanciare una moneta per decidere il destino del ragazzo per caso. Improvvisamente, Batman arriva e gli ordina di fermarsi, dicendogli che sta incolpando le persone sbagliate per la morte di Rachel. Due Facce lancia quindi la moneta per Batman. La moneta cade con il lato sporco verso l’alto, quindi gli spara. La lancia per se stesso. La moneta esce con il lato pulito verso l’alto. Poi riprende il suo piano originale e la lancia per il piccolo Jimmy. Nel momento definitivo, Batman si alza e affronta Due Facce, facendolo cadere da un cornicione.

Batman si lamenta del fatto che il Joker ha comunque vinto perché ha corrotto Harvey Dent, ha diviso la loro alleanza per sempre e ha distrutto una delle persone migliori di Gotham. Se la gente di Gotham dovesse mai scoprire i torti che Due Facce ha fatto, il futuro di Gotham sarebbe compromesso. Così, Batman decide di prendersi la colpa degli omicidi che Dent ha commesso come Due Facce, in modo che il Joker non possa vincere e la città rimanga in pace.

Gordon viene visto distruggere il simbolo del pipistrello sopra l’edificio MCU e poi inizia a inseguire Batman, che corre. Gordon dice a suo figlio che anche se Dent era l’eroe di cui Gotham aveva bisogno, Batman è l’eroe che Gotham merita. Viene lanciata una caccia all’uomo per Batman, che si allontana velocemente nel suo Batpod. Gordon dichiara: “È un guardiano silenzioso. Un vigile protettore. Un cavaliere oscuro.”

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