Jackson raggiunse Bristoe Station sulla Orange and Alexandria Railroad nel pomeriggio del 26, dove le sue truppe procedettero a distruggere due treni e strappare diverse miglia di binari. Quando apprese che c’era un deposito di rifornimenti dell’Unione a Manassas Junction diverse miglia a nord-est, Jackson staccò la brigata di Isaac R. Trimble insieme al supporto della cavalleria per catturare la giunzione. Dopo una marcia notturna Trimble lanciò un attacco che conquistò la piccola guarnigione dell’Unione, catturando oltre 300 prigionieri e otto cannoni, con la perdita di quattro uomini. Dopo aver ricevuto la notizia dell’attacco confederato a Manassas Junction durante la notte, Pope cercò di lanciare diverse colonne dell’Unione contro l’ala di Jackson per circondare i confederati. Egli fece marciare l’Armata della Virginia verso nord-est in direzione di Manassas e ordinò ai distaccamenti delle forze dell’Unione a Washington di muoversi per ferrovia verso ovest fino a Manassas. Le brigate di George W. Taylor e E. Parker Scammon partirono la mattina del 27 agosto. Nel frattempo, Jackson lasciò la divisione di Richard S. Ewell a Bristoe’s Station per sorvegliare le forze dell’Unione e spostò le divisioni di A. P. Hill e William B. Taliaferro per rinforzare la brigata di Trimble.
Appena la divisione di Hill arrivò a Manassas Junction, Trimble fu attaccato dalla 2nd New York Heavy Artillery, ma l’attacco fu rapidamente respinto con l’aiuto di Hill. A questo punto, Taylor arrivò in treno e, ignaro di essere in minoranza, procedette a schierare la sua brigata per un attacco. Il pesante fuoco confederato, specialmente quello dell’artiglieria, fece sbandare la brigata di Taylor e Taylor stesso fu ferito mortalmente. I due reggimenti di Scammon arrivarono e servirono come retroguardia per coprire la ritirata dell’Unione. Le perdite dell’Unione ammontarono a quasi 450 (inclusi più di 200 prigionieri), mentre i confederati persero solo venticinque uomini.
A ovest, Ewell schierò la sua divisione lungo Kettle Run per proteggere le retrovie di Jackson dalle forze di Pope. La divisione di Joseph Hooker del III Corpo dell’Unione incontrò per la prima volta gli schermagliatori di Ewell verso le 14:30. Ewell fu in grado di mantenere la sua posizione per oltre un’ora, ma Hooker portò la sua artiglieria e cercò di aggirare la linea confederata. Poco dopo le 16, Ewell ricevette l’ordine da Jackson di ritirarsi a Manassas Junction e si sganciò con successo; Hooker non fu in grado di inseguirlo a causa del ponte su Broad Run a nord che fu bruciato. Ewell perse meno di 150 uomini nel combattimento, mentre Hooker ne perse 400.