Parole chiave
COVID-19; Coronavirus; SARS-CoVs; MERS-CoV
Introduzione
COVID-19 è una malattia simile alla polmonite. È causata da un nuovocoronavirus, chiamato SARS-CoV-2; che è simile al virus della sindrome respiratoria acuta grave (SARS).
L’interconnessione nel mondo è stata una manna per la SARS-CoV-2. Senza aerei, treni e automobili il virus non sarebbe arrivato così lontano e velocemente. Al contrario, l’interconnessione può essere anche la sua rovina. Perché gli scienziati di tutto il mondo si stanno concentrando sul suo genoma e sulle 27 proteine che produce, approfondendo gradualmente la loro comprensione e trovando il modo di fermarlo.
Anatomia del COVID-19
In un primo momento il nuovo virus fu chiamato 2019-nCoV. Successivamente, i ricercatori del Comitato Internazionale per la Tassonomia dei Virus (ICTV) lo hanno chiamato virus SARS-CoV-2 poiché è stato trovato simile a quello che ha causato l’epidemia di SARS (SARS-CoVs).
I CoV sono diventati i microrganismi significativi dell’infezione respiratoria. I CoV sono una grande famiglia di virus a singolo filamento di RNA (+ssRNA) che possono essere isolati in diverse specie animali. Possono causare malattie negli esseri umani che vanno dal comune raffreddore a malattie più gravi come MERS e SARS.SARS hanno molto probabilmente iniziato da pipistrelli e dopo lo spostamento in altri ospiti mammiferi, per esempio, il palmcivet himalayano per SARS-CoV, e cammello dromedario per MERS-CoV – prima di saltare agli esseri umani.
Eziologia COVID-19
I CoV sono virus a RNA a filamento positivo con una struttura a corona quando osservati al microscopio elettronico, a causa della presenza di glicoproteine spike sull’involucro. Ci sono 4major categorie di coronavirus: Alphacoronavirus (α-CoV), Betacoronavirus (β-CoV), Deltacoronavirus (-CoV), andGammacoronavirus (ƴ-CoV). Solo α & β coronavirus in grado di infettare i mammiferi/umani e come per genomiccharacterization è stato rivelato che i pipistrelli e roditori sono thegene fonti di α-CoVs e β-CoVs. Le specie aviarie sono risultate essere le fonti genetiche di δ-CoVs e ƴ-CoVs e tendono a infettare gli uccelli.
7 coronavirus umani (HCoVs) sono stati identificati fino ad oggi: HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV (causa la sindrome respiratoria acuta grave), MERS-CoV (sindrome respiratoria del Medio Oriente) e ora SARS-CoV-2.
SARS-CoV-2 appartiene alla categoria dei β-CoVs. È generalmente di forma rotonda/ellittica o pleomorfa, con diametro ≈ 60-140nm. È anche sensibile alla luce UV e al calore, come altri CoV. La temperatura di inattivazione del SARS-CoV-2 è di circa 27° C. Al contrario, può anche resistere al freddo sotto 0°C. Inoltre, può essere inattivato da solventi lipidici come etere (75%), etanolo, disinfettante contenente cloro, acido perossiacetico e cloroformio, tranne la clorexidina.
Si è scoperto che la sequenza del genoma di SARS-CoV-2 è identica al 96,2% a quella di un CoV di pipistrello RaTG13, mentre condivide il 79,5% di identità con SARS-CoV. Sulla base di questa analisi evolutiva dei risultati del genomesequencing del virus &, si sospetta che il pipistrello sia un ospite naturale dell’origine di questo virus, e che la SARS-CoV-2 potrebbe essere stata trasmessa dai pipistrelli attraverso ospiti intermedi sconosciuti per infettare gli esseri umani.
Genetica dei Coronavirus
Coronavirus, questo nome è stato coniato perché assomiglia agli aloni (conosciuti come corone) al microscopio elettronico. Un genoma di coronavirus typicalgeneric è un singolo filamento di RNA, che è32 kilobase lungo, ed è noto per essere il più grande RNA virusgenome. Questi virus ricombinano ad una frequenza più alta di qualsiasi altro virus a RNA a filamento positivo, volendo consolidare le informazioni genetiche da varie fonti quando un ospite viene infettato da più coronavirus. In altre parole, i coronavirus mutano e cambiano ad un alto tasso, il che si traduce in un ostacolo sia per il rilevamento diagnostico che per la terapia (e i vaccini).
I coronavirus hanno un processo di replicazione molto insolito, che coinvolge un meccanismo di replicazione a 2 fasi. Alcuni RNA virusgenomi contengono un singolo open reading frame (ORF), che viene poi tradotto come una singola poliproteina, questa poliproteina viene cataliticamente scissa in proteine virali funzionali più piccole. Ma i coronavirus contengono fino a 10 ORF individuali. La maggior parte dei coronavirus traduce la più grande di queste ORF, chiamata replicasi, che da sola è equivalente al doppio della dimensione degli altri genomi virali RNA. Questo gene della replicasi codifica una serie di enzimi che utilizzano il genoma rimanente come modello per produrre una combinazione di molecole di RNA messaggero più piccole e sovrapposte, che vengono ulteriormente tradotte in proteine strutturali (i mattoni delle nuove particelle virali).