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エネルギー産生。 慢性疲労症候群の人では、体内の細胞が十分なエネルギーを作れなくなります。

脳の異常。 脳の写真（MRIやCTスキャンなど）、脳内ホルモンのレベル、脳の電気系統（脳波）に異常がみられます。 これらの異常は現れたり消えたりすることがあり、必ずしも永久的なものではありません。

血圧と脈拍の問題。 起立時に血圧が下がり、心臓の拍動の速さが増すことがあります。 血圧が下がりすぎると、失神しそうになったり、実際に失神したりすることもあります。 いくつかの研究では、特定の遺伝子の構造に異常があることが分かっています。 また、ある種の遺伝子が細胞内でオン・オフされる仕組みに異常があることもわかっています。 一卵性双生児や非一卵性双生児の研究から、遺伝的に病気になりやすい人がいることが分かっています

感染症や他の病気。 慢性疲労症候群は、常にではありませんが、突然の感染症のような病気（発熱、喉の痛み、筋肉の痛み、胃の不調）で始まることがよくあります。 研究により、エプスタイン・バー・ウイルス（単核球症の一般的な原因）、ライム病菌、Q熱菌など、いくつかの異なる種類の感染性物質が病気の始まりを誘発することが分かっています

セロトニンとコルチゾール いくつかの研究から、主要な脳内化学物質であるセロトニンが慢性疲労症候群の症状に重要であることが示されています。 この病気の人は、ストレスに反応して体内で分泌されるホルモンであるコルチゾールのレベルが低いのです

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