Drosophila simulansとその島嶼派生種Drosophila mauritianaとの交配による子孫では、雌の雑種は稔性があるが雄の雑種は不稔性である。 最近の研究から、ショウジョウバエの性別決定に重要な遺伝子である性致死遺伝子が、D. melanogasterとD. simulansのハイブリッドでは、調査した非性致死遺伝子のミスレギュレーションの程度と比較して、高度にミスレギュレートされていることが明らかにされた。 D. melanogasterの母親からの雄ハイブリッドでは、雄特異的複合体がX染色体に再局在化した結果、性致死遺伝子がしばしば異常発現し、雄性不妊の一因となっていることが明らかになった。 5355>

D. pseudoananassaeとD. bipectinata、D. pseudoananassaeとD. parabipectinata、D. pseudoananassaeとD. malerkotliana間の交配実験により、さらにY染色体が雑種雄不妊に関与していることが明らかにされた。 Y染色体の相互作用として考えられるのは、X-Y、Y-autosome、Y-cytoplasmである。 不妊の雄はY染色体に共役常染色体のセットを持ち、その結果、Y優勢常染色体相互作用のために受胎可能である。 しかし、Drosophila paulistorumではY染色体と細胞質が異なる親に由来する場合、雄は通常不妊であることを示唆する情報がある。 X-Y相互作用は、雄の雑種における不妊の最も可能性の高い原因である。

性染色体の有無が性別を決定する種の間で考えられるもう一つの不妊の原因は、一方の種の性染色体に劣性対立遺伝子があり、相手種の常染色体の対立遺伝子と相互作用している場合である。 この場合、雑種の異型性染色体は不妊となり、同型性染色体は受精卵となる可能性があります。 その結果、例えばY染色体の有無が性別を決定する種では、XY染色体を持つ個体（オス）は不妊となり、XX染色体を持つ個体（メス）は受胎可能な個体となるのです。 5355>

また、無脊椎動物に微生物が感染すると、宿主の子孫の性別や生殖能力が変化することも明らかにされている。 例えば、線虫やショウジョウバエなどの節足動物にリケッチア菌であるウォルバキアが感染すると、雄特有の不妊症が生じ、これは雌の系統を通じて感染することで先天的に変化する

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