I have limited experience since I’m only on my second playthrough but so far I observed –

If you join the Minutemen you end up alied with the Railroad and the Brotherhood of Steel and the Institute will destroying the end up to be.

また、ミニッツメンのミッション（城の奪還まで）を進めていると、研究所がウォレスをバイオサイエンスチームに「招待」しようとするミッションで、ウォレスの救難信号に反応するのはミニッツメンです（したがって、彼らを説得する機会が与えられます）。 ミニットマンに参加していない場合は、ガナーズがウォレスの呼びかけに応えてくれます。 ミニッツメンのストーリーを進めると、大砲のアンロックに加えて、多数のミニッツメンのグループが荒野をパトロールするようになります。

鋼鉄の同胞団に参加すると、ミニッツメンと同盟を組みながら研究所と鉄道に対して宣戦布告することになる。

鉄道に入ればミニットマンと同盟して鋼鉄の一揆と研究所を破壊する。

If you join the Institute you’re alied with the Minutemen and destroy the Railroad and the Brotherhood of Steel.

After completing the storyline allied with the Institute, synths groups are showing up throughout the commonwealth now in charge – They also set up various checkpoints and roaming killing mutants and raider will be wtelands.Alls of the Institute.

どの選択肢を選んでも

「父」は死にますが、研究所と同盟していない場合はカットシーンが異なります。 研究所を攻撃すると、ファストトラベルの場所として使えなくなります。 なお、全滅させた派閥は最後のカットシーンの後、ミッションに参加できなくなります