Vele bacteriële soorten zijn beweeglijk door middel van flagella. De structuur en de inplanting van de flagella lijken verband te houden met de specifieke omgeving waarin de cellen leven. In sommige gevallen passen de bacteriën zelfs hun flagellapatroon aan als reactie op de omgevingsomstandigheden waarmee zij te maken krijgen. De differentiatie van zwermcellen is een opmerkelijk voorbeeld van dit verschijnsel. Flagellen lijken meer functies te hebben dan het verschaffen van motiliteit alleen. Voor veel pathogene soorten zijn studies verricht naar de bijdrage van flagella tot de virulentie, maar het resultaat is niet in alle gevallen duidelijk. Algemeen wordt aangenomen dat flagellen belangrijke virulentiefactoren zijn, en in verscheidene gevallen is aangetoond dat expressie en repressie van flagellen en virulentie met elkaar verband houden. Het verschaffen van motiliteit is altijd een belangrijk kenmerk van flagella van pathogene bacteriën, maar ook kleefkracht en andere eigenschappen zijn aan deze flagella toegeschreven. Bij niet-pathogene bacteriële kolonisatie zijn flagellen ook belangrijke voortbewegings- en kleeforganellen. In verschillende gevallen waarin concurrentie bestaat tussen verschillende bacteriesoorten, is aangetoond dat motiliteit door middel van flagella een specifiek voordeel oplevert voor een bacterie. Dit overzicht geeft een overzicht van studies die zijn uitgevoerd naar de betekenis van flagellatie in een grote verscheidenheid van processen waarbij gevlagelleerde bacteriën betrokken zijn.