In 1991 vertelde Eddie Vedder aan Kim Neely van Rolling Stone dat de naam Pearl Jam verwees naar de overgrootmoeder van de zanger, en met name naar een bepaald speciaal recept van haar. “Overgrootmoeder Pearl maakte altijd een hallucinogene conserve waarover alle verhalen de ronde doen,” zei Vedder. Maar we hebben het recept niet.”
Het verhaal kan wel in een of twee familiebijeenkomsten naar boven zijn gekomen, want in 2006 gaf Vedder aan Brian Vedder van Rolling Stone toe dat hij de feiten misschien een beetje had verfraaid. In feite is alleen het feit dat zijn overgrootmoeder Pearl heette waar, en de rest is “totale onzin”. Pearl Jam-bassist Jeff Ament en gitarist Mike McCready gaven vervolgens het echte verhaal: Ze heetten oorspronkelijk “Mookie Blaylock” naar de NBA-legende, wiens rugnummer ook de titel was van het debuutalbum van de band, Ten. De band was wanhopig op zoek naar iets beters en tijdens een brainstormsessie in een restaurant in Seattle, slaagde Ament erin om “Pearl” tevoorschijn te toveren. Het “Jam”-gedeelte van de naam werd toegevoegd na een concert van Neil Young waar, zoals Ament het zegt, “elk nummer een soort jam van vijftien of twintig minuten was.”