De website van de Missouri Synode onderscheidt drie hoofdgebieden van verschil tussen de Lutherse Kerk Missouri Synode (LCMS) en de Evangelisch Lutherse Kerk in Amerika (ELCA):
1.De leer en het gezag van de Schrift – De LCMS gelooft dat de Bijbel foutloos is in alles wat hij zegt. ELCA vermijdt dergelijke uitspraken en is van mening dat de Schrift niet noodzakelijkerwijs altijd nauwkeurig is in zaken als geschiedenis en wetenschap. Verschillen tussen de LCMS en de ELCA over het gezag van de Schrift verklaren ook waarom de LCMS geen vrouwen wijdt (gebaseerd op 1 Korintiërs 14:33-36, 1 Timoteüs 2:11-14), homoseksueel gedrag als strijdig met Gods wil beschouwt (Romeinen 1:18-28, 1 Korintiërs 6:9), en de wijding van praktiserende homoseksuelen niet toestaat.
2.De toewijding aan de Lutherse belijdenisgeschriften – De ELCA bevestigt haar toewijding aan het Evangelie van Jezus Christus zoals daarvan getuigd wordt in de Lutherse belijdenissen, maar neigt er ook toe het historische karakter van deze geschriften te benadrukken en de mogelijkheid open te houden om af te wijken van belijdenisstandpunten die niet rechtstreeks betrekking hebben op het Evangelie zelf in engere zin opgevat. Alle voorgangers van de LCMS daarentegen zijn verplicht te bevestigen dat de Lutherse belijdenissen een juiste uitleg zijn van de leer van de Schrift.
3.De mate van overeenstemming die nodig is om samen te komen in één kerkelijk lichaam – Terwijl de LCMS gelooft dat de Bijbel overeenstemming vereist in alles wat de Bijbel leert, is de ELCA van mening dat onenigheid in sommige leerstellige zaken, zoals de wijze van Christus’ aanwezigheid in het Heilig Avondmaal, de kerkelijke gemeenschap niet verbiedt.
En met betrekking tot de Wisconsin Evangelisch Lutherse Synode (WELS), identificeert de Missouri Synode deze verschillen vanuit haar perspectief:
1.Het bijbelse begrip van gemeenschap – De WELS heeft wat zij noemt een “eenheidsbegrip” van gemeenschap, dat elke gezamenlijke uitdrukking, manifestatie en demonstratie van een gemeenschappelijk geloof omvat. De LCMS ziet kerkelijke gemeenschap als mogelijk op verschillende niveaus, b.v. gebedsgemeenschap (die geen volledige doctrinaire overeenstemming vereist) is mogelijk zelfs wanneer altaar- en kanselgemeenschap (die volledige doctrinaire overeenstemming vereist) misschien niet mogelijk is.
2. De leer van het ambt – Voor de LCMS is het ambt van het openbaar ambt (het pastorale ambt) volgens de Schrift het enige door God ingestelde
ambt in de kerk, terwijl de kerk de vrijheid bezit om door menselijke instelling van tijd tot tijd andere ambten in het leven te roepen om bij te staan in de uitvoering van de functies van het pastorale ambt. De “Theses on Church and Ministry” van de WELS ontkennen echter uitdrukkelijk dat het pastoraat specifiek door de Heer is ingesteld in tegenstelling tot andere vormen van openbaar ambt.
3. De rol van de vrouw in de kerk – Hoewel zowel de LCMS als de WELS zich op Schriftuurlijke gronden sterk verzetten tegen de wijding van vrouwen tot het pastorale ambt, heeft de LCMS geconcludeerd dat de Schrift het vrouwenkiesrecht in de kerk niet verbiedt. De WELS is tegen vrouwenkiesrecht in de kerk als strijdig met de Schrift.