A magnézium a természetben mindenütt előforduló elem. A magnézium- és a kalcium-anyagcsere szorosan összefügg. A két ion bélrendszeri felszívódása és vesekiválasztása kölcsönösen függ egymástól. A foszfor és a magnézium anyagcseréje közötti kapcsolatot nehezebb kimutatni. A gyermekkori hipomagnezémia leggyakoribb okai a csökkent bevitel, a károsodott bélfelszívódás, a vesekárosodás és a genetikai betegségek. A hipomagnezémia klinikailag az idegrendszerben tükröződik, neurofiziológiai és metabolikus változások jelentkeznek. A súlyos hipomagnezémia a patkányok kivételével a legtöbb kísérleti állatban másodlagos hipokalcémiát idéz elő. A súlyos hipomagnezémia továbbá funkcionális hipoparatireózis kialakulását idézi elő. In vitro vizsgálatok kimutatták, hogy a magnézium a kalciumhoz hasonlóan képes modulálni a parathormon (PTH) szekrécióját. A magnéziumkoncentráció akut csökkenése serkenti a PTH-szekréciót, a koncentráció akut növekedése pedig csökkenti a szekréciót. A magnézium valószínűleg fontos szerepet játszik a D-vitamin anyagcseréjében. Néhány hipokalcémiás és magnéziumhiányos beteg rezisztens a farmakológiai D-vitamin-dózisokkal szemben, vagy a magnéziumfüggő D-vitamin-rezisztens rachitis egy formája alakulhat ki. Megfigyelték, hogy a foszfáthiányt a vizelet magnézium- és kalciumszintjének növekedése kíséri. A gyermekgyógyászatban a foszfáthiány szindrómája különösen gyakran figyelhető meg koraszülötteknél, akik gyakran kapnak alacsony P-értékű étrendet. A magnézium számos, a sejtben lejátszódó biokémiai reakcióban vesz részt, különösen az ATP képződését és felhasználását érintő folyamatokban. Így sejtszinten a magnézium kulcsszerepet játszik az ionszállítási folyamatokban.