V roce 1991 řekl Eddie Vedder Kim Neelyové z časopisu Rolling Stone, že název Pearl Jam odkazuje na zpěvákovu prababičku a zejména na jistý její speciální recept. „Prababička Pearl dělávala takovou halucinogenní zavařeninu, o které kolují úplné historky,“ řekl Vedder. Recept ale nemáme.“
Tato historka však mohla vzniknout na jednom nebo dvou rodinných setkáních, protože v roce 2006 Vedder přiznal Brianu Vedderovi z časopisu Rolling Stone, že si možná fakta trochu přikrášlil. Ve skutečnosti je pravdivý pouze fakt, že se jeho prababička jmenovala Pearl, a zbytek je „totální bulls**t“. Baskytarista Pearl Jam Jeff Ament a kytarista Mike McCready pak poskytli skutečný příběh: Původně se jmenovali „Mookie Blaylock“ podle legendy NBA, jejíž číslo dresu bylo také názvem debutového alba kapely Ten. Kapela se dost zoufale snažila vymyslet něco lepšího a při brainstormingu v jedné seattleské restauraci se Amentovi podařilo vykouzlit „Pearl“. Část názvu „Jam“ byla přidána po koncertě Neila Younga, kde, jak říká Ament, „každá píseň byla jako patnáctiminutový nebo dvacetiminutový jam.“
.