Factores bióticos y abióticos conforman la inversión en defensas costosas. Los sistemas inmunitarios de vertebrados e invertebrados difieren en su coste de fitness. Sin embargo, el comportamiento higiénico de ambos puede dar lugar a un aumento de la tasa de supervivencia y del coste de fitness. La respuesta inmunitaria de los vertebrados ha desarrollado mecanismos más sofisticados y complicados que incluyen una memoria inmunológica con la generación de grandes receptores de reconocimiento de antígenos y sistemas inmunitarios innatos. El sistema inmunitario de los invertebrados debe recurrir a moléculas que no son de autorreconocimiento para garantizar una respuesta de defensa eficaz contra los patógenos infecciosos que amenazan continuamente su supervivencia. El lipopolisacárido (LPS), procedente de la endotoxina bacteriana, ha sido considerado como una molécula potencialmente implicada en el reconocimiento y la defensa inmunitaria. Esta revisión se centra en una visión general de la endotoxina bacteriana, LPS, y se discute su estructura, función y elucidación de las respuestas inmunes tanto en vertebrados como en invertebrados. Además, se revisa en detalle la defensa de los invertebrados contra los LPS. Los mecanismos precisos que subyacen al autorreconocimiento y al no autorreconocimiento representan la base para prevenir y controlar las infecciones por endotoxinas, así como para estimular la resistencia de los animales. Esto es particularmente relevante para la defensa inmune contra los LPS en invertebrados y vertebrados que están frecuentemente limitados por enfermedades recurrentes.