Missouri-synodin verkkosivuilla yksilöidään kolme pääasiallista eroa luterilaisen kirkon Missouri-synodin (LCMS) ja Amerikan evankelis-luterilaisen kirkon (ELCA) välillä:

1. Raamatun oppi ja auktoriteetti – LCMS uskoo, että Raamattu on virheetön kaikessa, mitä se sanoo. ELCA välttää tällaisia väitteitä ja katsoo, että Raamattu ei välttämättä ole aina tarkka esimerkiksi historian ja tieteen kaltaisissa asioissa. LCMS:n ja ELCA:n erot Raamatun auktoriteetista selittävät osaltaan myös sitä, miksi LCMS ei ordinoi naisia (perustuen 1. Kor. 14:33-36, 1. Tim. 2:11-14), pitää homoseksuaalista käyttäytymistä Jumalan tahdon vastaisena (Room. 1:18-28, 1. Kor. 6:9) eikä salli harjoittavien homoseksuaalien ordinointia.

2. Sitoutuminen luterilaisiin tunnustuskirjoituksiin – Vaikka ELCA vahvistaa sitoutumisensa Jeesuksen Kristuksen evankeliumiin, sellaisena kuin se todistetaan luterilaisissa tunnustuskirjoituksissa, sillä on myös taipumus korostaa näiden kirjoitusten historiallista luonnetta ja ylläpitää mahdollisuutta erimielisyyteen tunnustuksellisista kannanotoista, jotka eivät suoranaisesti käsittele suppeassa merkityksessä ymmärrettyä evankeliumia itseään. Kaikkien LCMS:n pastoreiden on toisaalta vahvistettava, että luterilaiset tunnustuskirjat ovat oikea selitys Raamatun opetuksista.

3. Yhteen kirkkokuntaan liittymisen edellyttämä yhteisymmärryksen taso – Vaikka LCMS uskoo, että Raamattu edellyttää yhteisymmärrystä kaikessa, mitä Raamattu opettaa, ELCA:n mielestä erimielisyydet joistakin opinkysymyksistä, kuten Kristuksen läsnäolotavasta pyhässä ehtoollisessa, eivät kiellä kirkkoyhteyttä.

Ja Wisconsinin evankelisluterilaisen synodin (WELS) osalta Missouri-synodi yksilöi nämä erot omasta näkökulmastaan:

1. Raamatullinen käsitys yhteydestä – WELS:llä on ”yksikkökäsitteeksi” kutsuttu yhteyden käsite, joka kattaa kaikki yhteisen uskon yhteiset ilmaisut, ilmenemismuodot ja osoitukset. LCMS näkee seurakuntayhteyden mahdollisena eri tasoilla, esim. rukousyhteys (joka ei edellytä täyttä opillista yhteisymmärrystä) on mahdollista silloinkin, kun alttari- ja saarnastuoliyhteys (joka edellyttää täyttä opillista yhteisymmärrystä) ei ehkä ole mahdollista.

2. Virkaoppi – LCMS:lle julkisen viran virka (pastorin virka) on Raamatun mukaan ainoa jumalallisesti
perustettu virka kirkossa, kun taas kirkolla on vapaus luoda ajoittain inhimillisellä laitoksella muita virkoja avustamaan pastorin viran tehtävien hoitamisessa. WELS:n ”Teesit kirkosta ja palveluksesta” kiistävät kuitenkin nimenomaisesti sen, että pastoraalinen virka on nimenomaan Herran asettama, toisin kuin muut julkisen viran muodot.

3. Naisten asema kirkossa – Vaikka sekä LCMS että WELS vastustavat jyrkästi naisten vihkimistä pastoraaliseen virkaan pyhiin kirjoituksiin perustuvin perustein, LCMS on tullut siihen johtopäätökseen, että Pyhät Kirjoitukset eivät kiellä naisen äänioikeutta kirkossa. WELS vastustaa naisten äänioikeutta kirkossa Raamatun vastaisena.