Ale bobry są wegetarianami i nigdy nie jedzą ryb, istnieje wiele sposobów, w jaki oddziałują na siebie. Pozytywne korzyści wynikające z działalności bobrów dla populacji ryb w dużej mierze wynikają z wycinania drzew i tworzenia siedlisk. Obie te funkcje tworzą znacznie większą różnorodność siedlisk rzecznych, które mogą być wykorzystywane przez ryby. Na przykład zanurzone korony ściętych drzew stanowią schronienie przed drapieżnikami dla narybku i legowiska dla dużych ryb; wycinka dużych drzew w ciekach wodnych może tworzyć systemy ryfli, które zapewniają przyszłe siedliska tarłowe, a różnorodność basenów i kanałów o różnej głębokości i temperaturze zapewnia szeroki zakres siedlisk dla różnych gatunków ryb. Działalność bobrów zwiększa przydatność siedlisk dla wielu gatunków bezkręgowców, co prowadzi do znacznego wzrostu zarówno różnorodności gatunkowej, jak i biomasy. Wiele z nich stanowi źródło pokarmu dla ryb.

Najważniejszym potencjalnym negatywnym oddziaływaniem bobrów na populacje ryb jest to, że ich kompleksy tam mogą mieć negatywny wpływ na migrację i dyspersję ryb. Mogą one również wpływać na żwir tarłowy i temperaturę wody. Tym potencjalnie negatywnym oddziaływaniom można jednak zapobiec poprzez odpowiednie zarządzanie. Wiele dowodów pochodzących ze Skandynawii i Ameryki Północnej wskazuje na to, że większość tam bobrowych jest przez większość czasu dostępna dla ryb łososiowatych oraz że nie ma wyraźnych dowodów na istnienie negatywnego związku między działalnością bobrów a rybami łososiowatymi na poziomie zlewni. Bez odpowiedniego zarządzania może wystąpić negatywny wpływ na migrację ryb łososiowatych podczas suchej jesieni w mniejszych strumieniach bocznych z czynnymi tamami bobrowymi, jednak wpływ ten będzie prawdopodobnie bardzo specyficzny dla danego miejsca. Większość potencjalnych negatywnych skutków oddziaływania bobrów na ryby związana jest z budową tam. Chociaż jest mało prawdopodobne, że działalność ta będzie miała znaczący wpływ na populacje ryb w skali zlewni, to jednak jest to główna kwestia, co do której wyrażono zaniepokojenie w Wielkiej Brytanii. Jeśli prawnie właściwe strategie zarządzania, w tym odstrzał, są dostępne tam, gdzie jest to konieczne do powstrzymania konfliktu, bobry prawdopodobnie zapewnią korzystny wpływ netto dla większości gatunków ryb, w tym tych o znaczeniu komercyjnym i rekreacyjnym.

Kemp, P.S., Worthington, T.A., Langford, T.E.L., Tree, A.R.J., Gaywood, M.J., 2011. Qualitative and quantitative effects of reintroduced beavers on stream fish. Fish and Fisheries 13, 158-181.

.