A növényeknek gyökerekre van szükségük, és bár egyes növények a levegőből vagy a gazdanövényekből szívják fel a vizet és a tápanyagokat, a legtöbb növény gyökerei szilárdan a talajba ágyazódnak, és itt megnézzük, mi a feladatuk. Először is a gyökerek (remélhetőleg) biztonságosan rögzítik a növényt a talajban a szél és az elhaladó állatok által okozott sérülések ellen. Másodszor, a növények a gyökereiken keresztül tápanyagokat vesznek fel a talajból, a komposztból vagy más termesztőközegből. Az alapvető folyamat a növény méretétől függetlenül ugyanaz, a talajhoz simuló alpoktól a hatalmas erdei fákig: a gyökérrendszer végén lévő apró gyökérszőrök szívják fel a vizet a talajból; a fákon és bokrokon látható hatalmas, vastag gyökerek arra szolgálnak, hogy a növényt szilárdan rögzítsék a talajban, a működő gyökerek nagy területen elterjedjenek, hogy a legtöbb vizet elérjék, és a felvett vizet és tápanyagokat a növény föld feletti, fotoszintézis céljából működő részeihez, például a levelekhez szállítsák. A növények csak vízben oldott tápanyagokat vesznek fel, így ezek is a gyökérszőrökön keresztül jutnak be. A közhiedelemmel ellentétben a gyökerek nem a víz felé nőnek – nem képesek távolról érzékelni a vizet -, hanem lefelé nőnek, mivel érzékelik a súlypontot, ezt a tulajdonságot geotropizmusnak nevezik, és elágazással terjednek, amíg a talajban lévő vízzel nem érintkeznek.
Az tehát elég nyilvánvaló, hogy a növények gyökereinek vízre van szükségük a talajban; ami talán nem annyira nyilvánvaló, az az, hogy a talajrészecskék közötti terekben a levegőből származó állandó oxigénellátásra is szükségük van. Az oxigén kritikus fontosságú a “légzéshez” minden növényi sejt számára, hogy energiát szabadítson fel mind a folyamatok működtetéséhez, mind a növekedéshez. Oxigén nélkül a gyökerek rövid ideig oxigén nélkül (anaerob módon) lélegeznek, de ez kevesebb energiát és mérgező melléktermékeket termel, amelyek elkezdik elpusztítani a sejteket. Ez az oka annak, hogy a hosszú távú vízborítás olyan nagy problémát jelent a növények számára, amelyek nem alkalmazkodtak a mocsárban vagy tóban való növekedéshez. Miután az apró gyökérszőrök elpusztultak, a talaj kiszáradása után pótolni kell őket, ami értékes tárolt energiát emészt fel, mielőtt a növény többi része növekedésnek indulhatna.
Az egyetlen jó hír az, hogy a télen nyugvó növényeknek sokkal kevesebb energiára van szükségük, és így általában tovább élik túl az áradást, mint az aktívan növekvő növények tavasszal és nyáron. Ha kertje egy részében rendszeres árvíz- vagy vizesedési problémája van, fontolja meg a talajszerkezet javítását a természetes vízelvezetés fokozása érdekében, vagy akár talajcsatornák telepítését a felesleges víz elvezetésére. Alternatív megoldásként a természeti adottságokat egy mocsárkert kialakítására is felhasználhatja.