Az elmúlt néhány évtizedben a probiotikumok alkalmazása példátlanul elterjedt a bél általános egészségének előmozdítására, valamint bioterápiás gyógyszerként való bevezetésük a dysbiosishoz kapcsolódó bizonyos klinikai rendellenességek enyhítésére. Miközben számos tanulmány igazolta a mikrobafajok egy korlátozott csoportjának egészségmegőrző potenciálját, a hasonló probiotikus címke piaci extrapolálása a nagyszámú, részben jellemzett mikrobás készítményre elfogultnak tűnik. Különösen az újszülöttkori stádiumban lévő egyének és/vagy azok, akik bizonyos klinikai állapotokban szenvednek, beleértve a rosszindulatú daganatos betegségeket, a szivárgó bélrendszert, a cukorbetegséget és a szervátültetés utáni lábadozást, valószínűleg nem élvezik a probiotikumok előnyeit. Tovább súlyosbítja a helyzetet, hogy egyes probiotikus törzsek kihasználhatják e sérülékeny csoportok gyenge immunitását, és opportunista kórokozókká válva életveszélyes tüdőgyulladást, endokarditiszt és szepszist idézhetnek elő. Ezenkívül a probiotikumok szabályozatlan és burjánzó használata potenciálisan magában hordozza a plazmidok által közvetített antibiotikum-rezisztencia átvitelének kockázatát a bélfertőző kórokozókra. Ebben az áttekintésben a probiotikumok biztonsági kilátásait és terápiás beavatkozásaikat tárgyaljuk bizonyos veszélyeztetett népességcsoportokban. A megtestesült érvek és hipotézisek minden bizonnyal rávilágítanak arra, hogy miért kell óvatosan kezelni a probiotikumok használatát.