Många bakteriearter är rörliga med hjälp av flageller. Flagellas struktur och inplantering verkar vara relaterad till de specifika miljöer som cellerna lever i. I vissa fall anpassar bakterierna till och med sitt flagellmönster som svar på de miljöförhållanden de möter. Svärmande celldifferentiering är ett anmärkningsvärt exempel på detta fenomen. Flageller verkar ha fler funktioner än att enbart tillhandahålla motilitet. För många patogena arter har studier utförts om flagellernas bidrag till virulensen, men resultatet är inte entydigt i alla fall. Flageller är allmänt accepterade som viktiga virulensfaktorer, och uttryck och repression av flageller och virulens har i flera fall visat sig vara kopplade till varandra. Att tillhandahålla motilitet är alltid en viktig egenskap hos flagellerna hos patogena bakterier, men även adhesiva och andra egenskaper har tillskrivits dessa flageller. Vid kolonisering av icke-patogena bakterier är flagellerna också viktiga lokomotiva och adhesiva organeller. I flera fall där det råder konkurrens mellan flera bakteriearter har det visat sig att motilitet med hjälp av flageller ger en specifik fördel för en bakterie. Denna översikt ger en översikt över studier som har utförts om flagellans betydelse i en mängd olika processer där flagellerade bakterier är inblandade.