Nyckelord

COVID-19; Coronavirus; SARS-CoVs; MERS-CoV

Introduktion

COVID-19 är en lunginflammationsliknande sjukdom. Den orsakas av ett nytt koronavirus, SARS-CoV-2, som liknar SARS-viruset (Severe-Acute Respiratory Syndrome).

Det faktum att världen är sammankopplad har varit en välsignelse för SARS-CoV-2. Utan flygplan, tåg och bilar skulle viruset inte ha nått så långt och snabbt. Tvärtom kan sammanlänkningen också bli dess undergång. För forskare över hela världen fokuserar på dess genom och de 27 proteiner som man vet att det producerar, för att gradvis fördjupa sin förståelse och hitta sätt att stoppa det i dess spår.

COVID-19:s anatomi

Till en början kallades det nya viruset för 2019-nCoV. Senare kallade forskarna i International Committee on Taxonomy ofViruses (ICTV) det för SARS-CoV-2 virus eftersom det har visat sig likna det som orsakade SARS-utbrottet (SARS-CoVs).

CoVs har blivit de viktigaste mikroorganismerna i samband med luftvägsinfektioner. CoVs är en stor familj av singlestrandedRNA-virus (+ssRNA) som kan isoleras i olika djurarter. De kan orsaka sjukdomar hos människor som sträcker sig från vanlig förkylning till allvarligare sjukdomar som MERS och SARS.SARS har troligen börjat från fladdermöss och sedan gått över till andra däggdjursvärdar, t.ex. Himalayapalmsnäcka för SARS-CoV och dromedarkamel för MERS-CoV, innan det har hoppat över till människor.

Etiologi COVID-19

CoVs är positivt strängade RNA-virus med en kronliknande struktur när de observeras i elektronmikroskop, på grund av förekomsten av spikglykoproteiner på höljet. Det finns fyra huvudkategorier av coronavirus: Alphacoronavirus (α-CoV), Betacoronavirus (β-CoV), Deltacoronavirus (-CoV) och Gammacoronavirus (ƴ-CoV). Endast α & β-coronavirus kan infektera däggdjur/människor och enligt genomisk karakterisering visade det sig att fladdermöss och gnagare är genkällor för α-CoVs och β-CoVs. Fågelarter visade sig vara genkällor för δ-CoVs och ƴ-CoVs och de tenderar att infektera fåglar.

7 humana coronavirus (HCoVs) har identifierats fram till idag: HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV(orsakar allvarligt akut respiratoriskt syndrom), MERS-CoV(Mellanösterns respiratoriska syndrom) och nu SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 tillhör kategorin β-CoVs. Den är i allmänhet av rund/elliptisk eller pleomorf form, med en diameter ≈ 60-140nm. Det är också känsligt för UV-ljus och värme, liksom andra CoVs. inaktiveringstemperaturen för SARS-CoV-2 är cirka 27° C. Tvärtom kan det också motstå kyla under 0° C. Dessutom kan den inaktiveras av lipidlösningsmedel som eter (75 %), etanol, klorinnehållande desinfektionsmedel, peroxiättiksyra och kloroform med undantag för klorhexidin.

Det upptäcktes att genomsekvensen av SARS-CoV-2 är 96,2 % identisk med en fladdermus-CoV RaTG13, medan den är 79,5 % identisk med SARS-CoV. Baserat på resultaten av denna genomsekvensering av viruset &utvecklingsanalysen misstänks fladdermöss vara en naturlig värd för detta virus ursprung, och SARS-CoV-2 kan ha överförts från fladdermöss via okända mellanliggande värdar för att infektera människor.

Coronavirus Genetik

Coronavirus, detta namn har myntats eftersom det ser ut som halos (kända som koronor) i elektronmikroskopet.Coronavirus är en stor familj av RNA-virus. Ett typiskt generiskt coronavirusgenom är en enda RNA-sträng som är 32 kilobaser lång och är känt för att vara det största RNA-virusgenomet. Dessa virus rekombinerar med högre frekvens än alla andra positivt strängade RNA-virus, vilket innebär att de vill konsolidera genetisk information från olika källor när en värd infekteras med flera coronavirus. Coronavirus muterar och förändras med andra ord med hög hastighet, vilket leder till ett problem för både diagnostisk upptäckt och behandlings- (och vaccin)regimer.

Coronavirus har en mycket ovanlig replikationsprocess, med en replikationsmekanism i två steg. Några få RNA-virusgenomer innehåller en enda öppen läsram (ORF), som sedan översätts till ett enda polyprotein. Detta polyprotein klyvs katalytiskt till mindre funktionella virusproteiner. Men coronavirus innehåller upp till 10 enskilda ORF:er. De flestaribosomerna översätter den största av dessa ORF:er, kallad replikas, som ensam är dubbelt så stor som andraRNA-virusgenom. Denna replikasgen kodar för en rad enzymer som använder det återstående genomet som mall för att producera en kombination av mindre, överlappande budbärar-RNAmolekyler, som översätts vidare till strukturella proteiner (byggstenarna i nya viruspartiklar).