Einige Chromosomenregionen sind aus Bequemlichkeit definiert worden, um über Genorte zu sprechen. Am wichtigsten ist die Unterscheidung zwischen der Chromosomenregion p und der Chromosomenregion q. Dies sind virtuelle Regionen, die in allen Chromosomen vorhanden sind.

Diagramm eines verdoppelten und kondensierten (Metaphase) eukaryotischen Chromosoms. (1) Chromatid – einer der beiden identischen Teile des Chromosoms nach der S-Phase. (2) Zentromer – der Punkt, an dem sich die beiden Chromatiden berühren und an dem die Mikrotubuli ansetzen. (3) Kurzer Arm (p). (4) Langer Arm (q).

Während der Zellteilung durchlaufen die Moleküle, aus denen die Chromosomen bestehen (DNA und Proteine), einen Kondensationsprozess (die so genannte Chromatinkondensation), der einen kompakten und kleinen Komplex bildet, der Chromatid genannt wird. Die Komplexe, die die verdoppelten DNA-Moleküle enthalten, die Schwesterchromatiden, werden durch das Zentromer (wo sich der Kinetochor zusammensetzt) aneinander befestigt. Das Zentromer unterteilt jedes Chromosom in zwei Bereiche: den kleineren, den p-Bereich, und den größeren, den q-Bereich. Die Schwesterchromatiden werden am Ende der Zellteilung auf jede Tochterzelle verteilt.

Die p-Region befindet sich im kürzeren Arm des Chromosoms (p steht für petit, französisch für klein), während die q-Region im größeren Arm liegt (als nächster Buchstabe im Alphabet nach p gewählt).

An beiden Enden eines Chromosoms befindet sich ein Telomer, eine Kappe aus DNA, die den Rest des Chromosoms vor Schäden schützt. Die Bereiche der p- und q-Regionen in der Nähe der Telomere sind die Subtelomere oder subtelomeren Regionen. Die Bereiche, die näher am Zentromer liegen, sind die perizentronomischen Regionen. Die interstitiellen Regionen schließlich sind die Teile der p- und q-Regionen, die sich weder in der Nähe des Zentromers noch der Telomere befinden, sondern ungefähr in der Mitte von p oder q.

Regionen eines Chromosoms