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Se han definido varias regiones cromosómicas por conveniencia para hablar de loci de genes. La más importante es la distinción entre la región cromosómica p y la región cromosómica q. Se trata de regiones virtuales que existen en todos los cromosomas.
Durante la división celular, las moléculas que componen los cromosomas (ADN y proteínas) sufren un proceso de condensación (llamado condensación de la cromatina) que forma un complejo compacto y pequeño llamado cromátida. Los complejos que contienen las moléculas de ADN duplicadas, las cromátidas hermanas, se unen entre sí por el centrómero (donde se ensambla el cinetocoro). El centrómero divide cada cromosoma en dos regiones: la más pequeña, que es la región p, y la más grande, la región q. Las cromátidas hermanas se distribuirán a cada célula hija al final de la división celular.
La región p está representada en el brazo más corto del cromosoma (p es de petit, pequeño en francés) mientras que la región q está en el brazo más grande (elegido como la siguiente letra del alfabeto después de la p).
En cada extremo de un cromosoma hay un telómero, una tapa de ADN que protege al resto del cromosoma de los daños. Las zonas de las regiones p y q cercanas a los telómeros son los subtelómeros, o regiones subteloméricas. Las zonas más cercanas al centrómero son las regiones pericentrales. Por último, las regiones intersticiales son las partes de las regiones p y q que no están cerca ni del centrómero ni de los telómeros, sino que están aproximadamente en medio de p o q.