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Sono state definite per comodità diverse regioni cromosomiche per parlare di loci genici. La più importante è la distinzione tra regione cromosomica p e regione cromosomica q. Queste sono regioni virtuali che esistono in tutti i cromosomi.
Durante la divisione cellulare, le molecole che compongono i cromosomi (DNA e proteine) subiscono un processo di condensazione (chiamato condensazione della cromatina) che forma un complesso compatto e piccolo chiamato cromatide. I complessi che contengono le molecole di DNA duplicate, i cromatidi fratelli, sono attaccati l’uno all’altro dal centromero (dove si assembla il cinetocoro). Il centromero divide ogni cromosoma in due regioni: la più piccola, che è la regione p, e la più grande, la regione q. I cromatidi fratelli saranno distribuiti ad ogni cellula figlia alla fine della divisione cellulare.
La regione p è rappresentata nel braccio più corto del cromosoma (p sta per petit, francese per piccolo) mentre la regione q è nel braccio più grande (scelto come lettera successiva nell’alfabeto dopo la p).
A entrambe le estremità di un cromosoma c’è un telomero, un cappuccio di DNA che protegge il resto del cromosoma dai danni. Le aree delle regioni p e q vicine ai telomeri sono i subtelomeri, o regioni subtelomeriche. Le aree più vicine al centromero sono le regioni pericentriche. Infine, le regioni interstiziali sono le parti delle regioni p e q che non sono vicine né al centromero né ai telomeri, ma sono approssimativamente nel mezzo di p o q.