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Regiões cromossômicas transversais foram definidas por conveniência, a fim de falar sobre os loci gênicos. O mais importante é a distinção entre região cromossômica p e região cromossômica q. Estas são regiões virtuais que existem em todos os cromossomos.
Durante a divisão celular, as moléculas que compõem os cromossomos (DNA e proteínas) sofrem um processo de condensação (chamado condensação de cromatina) que forma um complexo compacto e pequeno chamado cromatídeo. Os complexos que contêm as moléculas de DNA duplicadas, os cromatídeos irmãos, são ligados entre si pelo centrômero (onde o Kinetochore se monta). O centrômero divide cada cromossomo em duas regiões: a menor, que é a região p, e a maior, a região q. Os cromossomos irmãos serão distribuídos para cada célula filha no final da divisão celular.
A região p é representada no braço mais curto do cromossomo (p é para petit, francês para pequeno) enquanto a região q está no braço maior (escolhida como próxima letra em alfabeto após p).
Em qualquer extremidade de um cromossomo está um telômero, uma tampa de DNA que protege o resto do cromossomo de danos. As áreas das regiões p e q próximas aos telômeros são os subtelômeros, ou regiões subteloméricas. As áreas mais próximas do centômero são as regiões pericentronômicas. Finalmente, as regiões intersticiais são as partes das regiões p e q que não estão próximas nem do centrômero nem dos telômeros, mas estão mais ou menos no meio do p ou q.
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