Baia San Francisco, lungă de 80 km și lată de la 4,8 la 21 km, în vestul Californiei; se intră prin Golden Gate, o strâmtoare între două peninsule. Golful are o adâncime de până la 30 m (100 ft) pe alocuri, cu un canal adânc de 15 m (50 ft) menținut prin bara de nisip din largul Porții de Aur. San Francisco se află pe peninsula sudică; pe peninsula nordică se află suburbiile rezidențiale din comitatul Marin, în timp ce pe malul estic al golfului în formă de semilună se află orașe industriale precum Alameda, Oakland, Berkeley și Richmond. Valea Santa Clara, care face parte dintr-o mare depresiune paralelă cu coasta, este prelungirea spre uscat a golfului. Insula Angel, Alcatraz și insula Yerba Buena, împreună cu insula vecină Treasure Island (locul unei expoziții internaționale, 1939-40) se află în golf. Cu Golful San Pablo și Golful Suisun, portul natural al Golfului San Francisco este unul dintre cele mai bune din lume. Pe aceste golfuri secundare și pe strâmtoarea Carquinez, care le unește, se află orașele Vallejo, Benicia, Martinez și Pittsburg. Zona Golfului este deservită de o rețea de poduri, dintre care cele mai importante sunt Podul Golden Gate, Podul din Golful San Francisco-Oakland, Podul Richmond-San Rafael și Podul San Mateo-Hayward. Trans-Bay Tube, un tunel cu o lungime de 5,6 km între San Francisco și Oakland, este unul dintre cele mai lungi tuburi subacvatice de tranzit rapid din lume. Tunelul a fost construit special pentru a absorbi trepidațiile cutremurelor. În regiune se află mai multe instalații ale marinei americane. Navigatorul englez Sir Francis Drake a vizitat golful în 1579; spaniolii l-au explorat mai amănunțit la sfârșitul secolului al XVIII-lea.