Am o experiență limitată, deoarece sunt abia la al doilea playthrough, însă până acum am observat –

Dacă vă alăturați Minutemen, veți ajunge să vă aliați cu Calea Ferată și veți ajunge să distrugeți Frăția de Oțel și Institutul.

În plus, dacă ați progresat prin misiunile Minutemen (până la și inclusiv recucerirea castelului), atunci în timpul misiunii în care Institutul încearcă să-l „invite” pe Wallace să se alăture echipei lor Biosciences, vor fi Minutemen care vor răspunde la apelul de ajutor al lui Wallace (dându-vă astfel ocazia de a-i convinge să renunțe). Dacă nu v-ați alăturat celor de la Minutemen, Gunners vor apărea pentru a răspunde la apelul de ajutor al lui Wallace. Progresarea prin povestea Minutemen va duce, de asemenea, la numeroase grupuri de Minutemen rătăcitori care vor patrula prin pustietăți, în plus față de deblocarea artileriei.

Dacă vă alăturați Frăției de Oțel, veți declara război împotriva Institutului și Căii Ferate, fiind în același timp aliat cu Minutemen.

Dacă vă alăturați Căii Ferate, veți fi aliați cu Minutemen și veți distruge Frăția de Oțel și Institutul.

Dacă vă alăturați Institutului, veți fi aliați cu Minutemen și veți distruge Calea Ferată și Frăția de Oțel.

După ce ați terminat povestea aliată cu Institutul, grupuri de sintetizatori încep să apară peste tot în Commonwealth anunțând că Institutul este acum la conducere – ei vor înființa, de asemenea, o varietate de puncte de control și vor cutreiera pustietățile ucigând mutanți și raideri. Diverșii tovarăși pe care i-am folosit în timpul playthrough-ului meu nu s-au supărat că am trecut de partea Institutului, totuși mă aștept ca Deacon și Danse să o facă (din moment ce le-ai distrus facțiunile).

Indiferent de alegerea pe care o faci,

„Tatăl” va muri, însă cutscene-ul va fi diferit dacă nu ești aliat cu Institutul. Dacă ataci Institutul, vei pierde acel loc ca locație de călătorie rapidă. Orice facțiuni pe care le nimiciți nu vor mai fi disponibile pentru misiuni după cutscene-ul final.