Născut la 11 februarie 1805, la Fort Mandan, Jean Baptiste Charbonneau a fost fiul interpretului canadian francez Touissant Charbonneau și al soției sale Shoshone, Sacagawea.
Lewis și Clark au sosit pe teritoriul Hidatsa-Mandan în octombrie 1804 și i-au angajat pe bătrânul Charbonneau și pe Sacagawea ca o echipă de interpreți. Căpitanii aflaseră că Shoshones aveau o mare herghelie de cai. Ei erau nerăbdători ca Sacagawea, care vorbea shoshone, să-i însoțească pentru a negocia pentru caii necesari pentru a traversa munții vestici, în ciuda faptului că ea era însărcinată în șase luni la acel moment.
În timp ce expediția iernase la Fort Mandan, Lewis, la 11 februarie 1805, a înregistrat nașterea lui Jean Baptiste după cum urmează:
În timp ce expediția iernase la Fort Mandan, Lewis, la 11 februarie 1805, a consemnat nașterea lui Jean Baptiste după cum urmează În această seară, pe la ora cinci, una dintre soțiile lui Charbonneau a născut un băiat frumos. Este demn de remarcat faptul că acesta a fost primul copil pe care această femeie l-a născut și, așa cum se întâmplă de obicei în astfel de cazuri, travaliul ei a fost anevoios și durerile violente. Bazându-se pe ea pentru a acționa ca translator cu Shoshone, Lewis era îngrijorat de faptul că va naște în siguranță. În încercarea de a o ajuta să aducă pe lume copilul, el s-a sfătuit cu alții și apoi i-a administrat un mic amestec de apă și inelele zdrobite ale unui șarpe cu clopoței pentru a o ajuta să inducă nașterea. Deși Lewis era sceptic cu privire la acest tratament, jurnalul său indică faptul că ea a născut la scurt timp după ce a consumat poțiunea de șarpe cu clopoței: Dacă acest medicament a fost cu adevărat cauza sau nu, nu mă voi angaja să determin, dar… nu îl luase cu mai mult de zece minute înainte de a naște.
Cel mai nou membru al expediției de 33 de membri, Jean Baptiste era un băiat sănătos și activ, un mare favorit al lui Clark, care l-a poreclit Pomp și Pompy, pentru poznele sale de mic dansator pompos. Pe 7 aprilie 1805, călătorind într-o piroga (barcă pe râu) împreună cu mama sa, Jean Baptiste, în vârstă de 55 de zile, s-a alăturat expediției în timp ce Corpul a părăsit Fort Mandan pentru a-și continua călătoria spre Munții Stâncoși și poporul Sacagaweas.
Susceptibil la bolile copilăriei, Baptiste a suferit o boală gravă în timpul călătoriei de întoarcere în primăvara anului 1806. În timp ce Corpul a fost întârziat de zăpada adâncă care acoperea Traseul Lolo prin Munții Bitterroot, băiatul a contractat febră mare și gâtul și gâtul umflate, indicii poate de oreion sau amigdalită (și poate de dentiție). Căpitanii i-au aplicat pe gât cataplasme din ceapă sălbatică și un tencuială de sarve (pansament) făcută din roze de pin cu frunze lungi, Beaswax și ulei de urs amestecat, ceea ce a dus la însănătoșirea lui în două săptămâni și jumătate.
Clark, conducând un mic detașament din care făcea parte și familia Charbonneau, a explorat râul Yellowstone în timpul călătoriei de întoarcere. La 25 iulie 1806, au dat peste o formațiune de gresie neobișnuită, liberă, aflată pe malul sudic al râului, pe care căpitanul Clark a numit-o Pompys Tower, după Jean Baptiste, în vârstă de un an și jumătate. Numit astăzi Pompys Pillar, Clark, sub o umbră naturală protejată, și-a gravat propriul nume și data de 25 iulie, ziua sa de naștere. Gravura lui Clark, păstrată acum sub un scut de sticlă incasabilă, este considerată singura dovadă fizică de durată pe care Corpul de Armată a lăsat-o în peisaj în timpul călătoriei. În plus față de stâlp, Clark a numit un pârâu din apropiere Baptiests Creek în onoarea băiatului.
Tânărul a stârnit o afecțiune irezistibilă în inima lui Clark. Pe 17 august, când Corpul a ajuns înapoi în satele Hidatsa-Mandan și își luau rămas bun de la familia Charbonneau, Clark s-a oferit să-l crească pe copil ca pe propriul său fiu. Cu toate acestea, deoarece Jean Baptiste nu era încă înțărcat, s-a decis că părinții băiatului îl vor aduce la Clark la o dată ulterioară. Într-o scrisoare către Touissant Charbonneau, pe atunci lăsat la vatră din Corp, Clark a scris:
În ceea ce privește pe micul tău fiu (băiatul meu Pomp) știi foarte bine cât de mult țin la el și cât de nerăbdător sunt să îl iau și să îl cresc ca pe propriul meu copil. Îți mai spun încă o dată că dacă îl vei aduce pe fiul tău, Baptiest, la mine, îl voi educa și îl voi trata ca pe propriul meu copil – nu uit promisiunile pe care ți le-am făcut și le voi repeta acum pentru ca tu să fii sigur – Charbono, dacă dorești să trăiești cu albii și vei veni la mine, îți voi da o bucată de pământ și te voi aproviziona cu cai, vaci, & porci….Dorindu-ți ție și familiei tale un mare succes & cu așteptări nerăbdătoare de a-l vedea pe micul meu băiat dansator Baptiest, voi rămâne prietenul tău.
În 1809, Touissant Charbonneau și Sacagawea au călătorit pe Missouri până la St Louis cu Jean Baptiste. Toussaint, împreună cu toți oamenii înrolați din expediție, au primit fiecare mandate de pământ în valoare de 320 de acri. Acest lucru, plus bonul de 533,33 dolari, plata pentru serviciile sale de interpret (Sacagawea nu a primit nimic), a fost într-adevăr o avere pentru un om cu resurse economice atât de limitate. Cu toate acestea, Toussaint nu avea temperamentul necesar pentru a cultiva pământul și, la 26 martie 1811, și-a transferat titlul de proprietate asupra terenurilor lui Clark pentru 100,00 de dolari. În aprilie, el și Sacagawea s-au îmbarcat pe o barjă a Companiei de blănuri Missouri cu destinația Missouri superior, lăsându-l pe Baptiste în grija lui Clark pentru ca băiatul să-și poată începe educația.
După ce și-a terminat școala în St. Louis, Baptiste s-a întors la viața de frontieră. În 1823, la vârsta de 18 ani, în timp ce locuia într-un sat de negustori la gura de vărsare a râului Kansas, l-a întâlnit pe Prințul Paul Wilhelm de Wuertemberg, Germania, care se afla într-o misiune științifică în America. Combinația neobișnuită de aptitudini de frontieră și realizări culturale ale lui Baptistes l-a intrigat pe prinț, care l-a luat sub patronajul său. Tânărul l-a însoțit pe Paul în Europa, unde a fost expus la mediul sofisticat și aristocratic al unei curți germane. Baptiste s-a bucurat de stilul de viață regal timp de șase ani, devenind fluent în patru limbi și dobândind un background care mai târziu avea să-l marcheze ca o anomalie culturală la frontiera de vest.
Întorcându-se în America în 1829, a lăsat deoparte manierele sale cultivate și a căzut în existența dură și tumultoasă a omului de munte. A străbătut în lung și în lat Vestul american, vânând, prinzând capcane, călăuzind și explorând. În 1846-1847, a cercetat drumul spre vest, din New Mexico până în California, pentru Batalionul Mormon. Concediat în 1847, a fost numit Alcalde al Misiunii San Luis Rey, o funcție comparabilă cu cea de magistrat.
Tocat de abuzurile proprietarilor de pământuri față de anumiți indieni (care erau tratați ca niște sclavi virtuali), a demisionat din funcțiile sale oficiale și a intrat în debandada frenetică a goanei după aur din California. Evident, nu s-a îmbogățit, deoarece a fost înregistrat ca funcționar de hotel în Auburn, California, în 1861. În 1866, a părăsit Auburn împreună cu doi tovarăși și s-a îndreptat spre noile descoperiri de aur din Montana. Pe drum, Jean Baptiste, la vârsta de 61 de ani, a murit de pneumonie și a fost înmormântat într-un cimitir îndepărtat și primitiv din micul cătun din Valea Iordanului, Danner, Oregon. La 14 martie 1973, mormântul său a fost înscris în Registrul Național al Locurilor Istorice.