V důsledku pequotské války v roce 1637 byly novoanglické osady vstřícné k plánům na posílení koloniální obrany proti hrozbě indiánských útoků. Představitelé v Hartfordu předložili myšlenku vytvoření obranné aliance mezi podobně smýšlejícími osadami v oblasti – návrh, který důrazně vylučoval anglikánské obyvatele v Maine a svobodomyslné obyvatele Rhode Islandu. po několika letech jednání se v roce 1643 sešli v Bostonu delegáti z kolonií Connecticut, New Haven, Massachusetts Bay a Plymouth a vytvořili Spojené kolonie Nové Anglie, známější jako Novoanglická konfederace. Organizace se měla skládat ze dvou delegátů z každé ze čtyř členských kolonií. K přijetí jakéhokoli opatření bylo zapotřebí šest z osmi hlasů. Měla se konat pravidelná výroční zasedání, ale v případě nouze mohly být svolány dodatečné konference. členské kolonie byly motivovány ke vstupu nejen kvůli obavám z indiánských útoků, ale také kvůli hrozbám, které představovali Holanďané v Novém nizozemsku a Francouzi v Kanadě. Doufalo se také, že konfederace bude hledat řešení řady obtížných hraničních otázek. konfederace nebyla zamýšlena jako ústřední vláda pro novoanglické kolonie; každá si ponechala své vlastní vládní instituce.Mezi pravomoci Konfederace patřilo následující:

• Vyměřovat členským koloniím poplatky za náklady na obranu; poměrné poplatky měly být vybírány podle počtu mužů ve věku od 16 do 60 let žijících v každé kolonii.
• Požadovat, aby se členské kolonie podílely na navracení uprchlíků před spravedlností a uprchlých otroků. Tento druhý požadavek předjímal pozdější zákony o uprchlých otrocích.

Massachusettský záliv, největší z kolonií, rychle zjistil, že příliš mnoho pravomocí bylo předáno menším sousedům. V důsledku toho, když kolonie Bay čelila nepopulárnímu rozhodnutí Konfederace, jednoduše pokyn ignorovala. Connecticutské osady žily ve stínu Nizozemců v Novém Nizozemí a získaly potřebné hlasy pro účast v anglo-nizozemském konfliktu v 50. letech 16. století. Vzdálený Massachusettský záliv odmítl výzvu k akci respektovat. Není divu, že vliv Konfederace od této doby prudce poklesl, ale ke krátkému oživení došlo během ostrého konfliktu války krále Filipa (1675-76). původní Stanovy Konfederace spojených kolonií Nové Anglie z 19. května 1643 obsahovaly jako svůj druhý oddíl:

2. „Konfederace se skládá ze dvou částí: 1. Zasedání, které se konalo 19. května 1643, a 2. Zasedání, které se konalo 19. května 1643, a zasedání, které se konalo 19. května 1643. Zmíněné Spojené kolonie za sebe a své potomky tímto společně a nerozdílně uzavírají pevnou a trvalou smlouvu o přátelství a přátelství pro útok a obranu, vzájemnou radu a pomoc při všech spravedlivých příležitostech jak pro zachování a šíření pravdy a svobod evangelia, tak pro svou vlastní vzájemnou bezpečnost a blaho.

Perpetuita trvala pouze do roku 1684, kdy byla konfederace rozpuštěna. novoanglická konfederace byla malým prvním krokem k formální spolupráci mezi koloniemi. V roce 1686 měla koruna vytvořit dominium Nová Anglie, což bylo velmi nepopulární spojení New Yorku a New Jersey s novoanglickými koloniemi. Později, v předvečer francouzské a indiánské války, mělo sedm kolonií zvážit Albánský plán unie Bena Franklina, návrh federativní koloniální vlády. viz Časová tabulka indiánských válek.