Nach dem Pequot-Krieg von 1637 waren die Siedlungen in Neuengland offen für Pläne zur Stärkung der kolonialen Verteidigung gegen die Bedrohung durch Indianerangriffe. Nach mehrjährigen Verhandlungen trafen sich Delegierte aus Connecticut, New Haven, Massachusetts Bay und der Plymouth Colony 1643 in Boston und gründeten die United Colonies of New England, besser bekannt als die New England Confederation. Die Organisation sollte sich aus zwei Delegierten aus jeder der vier Mitgliedskolonien zusammensetzen. Sechs der acht Stimmen waren erforderlich, um eine Maßnahme zu verabschieden. Die Mitgliedskolonien waren nicht nur wegen der Angst vor Indianerangriffen zum Beitritt motiviert, sondern auch wegen der Bedrohung durch die Niederländer in Neu-Niederlande und die Franzosen in Kanada. Die Konföderation war nicht als Zentralregierung für die Neuengland-Kolonien gedacht; jede behielt ihre eigenen Regierungsinstitutionen.Zu den Befugnissen der Konföderation gehörten die folgenden:
- Die Mitgliedskolonien sollten für die Kosten der Verteidigung zur Kasse gebeten werden; anteilige Abgaben sollten auf die Zahl der in jeder Kolonie lebenden Männer im Alter von 16 bis 60 Jahren erhoben werden.
- Die Mitgliedskolonien sollten verpflichtet werden, sich an der Rückführung von Flüchtlingen vor der Justiz und entlaufenen Sklaven zu beteiligen. Letzteres war eine Vorwegnahme der späteren Gesetze für entlaufene Sklaven.
Massachusetts Bay, die größte der Kolonien, entdeckte schnell, dass sie zu viele Befugnisse an ihre kleineren Nachbarn abgetreten hatte. Als die Bay Colony mit einer unpopulären Entscheidung der Konföderation konfrontiert wurde, ignorierte sie die Anweisung einfach. Die Siedlungen in Connecticut lebten im Schatten der Niederländer in den Neuen Niederlanden und erhielten die notwendigen Stimmen für die Teilnahme am anglo-holländischen Konflikt der 1650er Jahre. Die entfernte Massachusetts Bay weigerte sich, der Aufforderung zum Handeln nachzukommen. Es überrascht nicht, dass der Einfluss der Konföderation von diesem Zeitpunkt an stark zurückging, aber während des erbitterten Konflikts des König-Philipp-Krieges (1675-76) kam es zu einer kurzen Wiederbelebung.
2 Die ursprünglichen Articles of Confederation of the United Colonies of New England vom 19. Mai 1643 enthielten als zweiten Abschnitt:
2. Die genannten Vereinigten Kolonien für sich selbst und ihre Nachkommen schließen hiermit gemeinsam und einzeln einen festen und ewigen Bund der Freundschaft und Freundschaft für Angriff und Verteidigung, gegenseitigen Rat und Beistand bei allen gerechten Gelegenheiten, sowohl für die Bewahrung und Verbreitung der Wahrheit und der Freiheiten des Evangeliums als auch für ihre eigene gegenseitige Sicherheit und Wohlfahrt.
Die Konföderation hatte nur bis 1684 Bestand, als sie aufgelöst wurde. Die Neuengland-Konföderation war ein erster kleiner Schritt in Richtung einer formellen Zusammenarbeit zwischen den Kolonien. Im Jahr 1686 gründete die Krone das Dominion of New England, einen höchst unpopulären Zusammenschluss von New York und New Jersey mit den Kolonien in Neuengland. Später, am Vorabend des Franzosen- und Indianerkrieges, zogen sieben Kolonien Ben Franklins Albany Plan of Union in Erwägung, einen Vorschlag für eine föderale Kolonialregierung (siehe Zeittafel der Indianerkriege).