Taxonomové klasifikují všechny živočichy živočišné říše, od jednobuněčných živočichů až po člověka, do kategorií, tzv. fylů. Každé fylum se dále dělí na třídu, řád, čeleď, rod a druh. Od poloviny 70. let 20. století prošla klasifikace pavouků změnami, zejména v kategoriích rodů a druhů, uvádí Jonathan Coddington, kurátor Smithonova národního přírodovědného muzea ve Washingtonu, D.C. Taxonomové používají pro klasifikaci všech organismů vědecké názvy, aby bylo možné organismus identifikovat po celém světě navzdory místním názvům a různým jazykům.
Fylie Arthropoda
Pavouci patří do fylogeneze Athropoda. Do tohoto fyla patří všichni živočichové s vnější kostrou (exoskeletem), která je tvořena rohovitou látkou zvanou chitin. Živočichové z tohoto fyla mají článkovaná těla a kloubové končetiny a přívěsky. Mají také nejméně tři páry nohou. Fylum Arthropoda zahrnuje hmyz, kraby, krevety, humry, mnohonožky a stonožky a pavouky.
Třída Arachnida
Fylum Arthropoda se dále dělí na třídy. Pavouci patří do třídy Arachnida. Příslušníci této třídy se nazývají pavoukovci. Do této třídy patří všichni členovci, kteří mají čtyři páry nohou, ale nemají tykadla ani křídla. Tělo členovců této třídy je článkované nebo srostlé v jednu část. Do třídy Arachnida patří pavouci, štíři, sběrači, roztoči a klíšťata. Pavouci se od ostatních zástupců této třídy liší tím, že mají dvě odlišné části těla, břicho a přední část zvanou hlavohruď. K hlavohrudi jsou připojeny oči a všechny nohy.
- Pavouci patří do fylogeneze Athropoda.
- Tělo členovců této třídy je článkované nebo srostlé v jednu část.
Řád Araneae
Třídy se dělí na řády. Pavouci patří do řádu Araneae. Je to jeden z 11 řádů třídy Arachnida. Pavouci tohoto řádu se od živočichů ostatních řádů liší způsobem připojení břicha k hlavohrudi, absencí segmentů v břiše a tím, že mají zadní orgán, spinneret, pro výrobu hedvábí. U pavouků je spojení mezi bříškem a hlavohrudí velmi tenké, zatímco štíři, sklípkani a roztoči mají spojení široké. Pavouci s různými vlastnostmi se dále dělí na několik podřádů.
Čeledi, rody a druhy
Řády a podřády pavouků se podle Jonathana Coddingtona dále dělí na přibližně 110 čeledí, 3 600 rodů a 39 000 druhů. Zařazení některých pavouků do těchto skupin se ještě může změnit. Taxonomové dosud neidentifikovali všechny existující pavouky a některé zařadili do nevhodných kategorií. Tyto kategorie klasifikují pavouky podle jejich linií, anatomických znaků a zvyků. Příkladem dobře charakterizovaného pavouka je pavouk domácí, který patří do čeledi Theridiidae a rodu a druhu Achaearanea tepidariorum.
- Třídy se dělí na řády.
- Pavouci tohoto řádu se od živočichů ostatních řádů liší způsobem připojení břicha k hlavohrudi, absencí článků v břiše a tím, že mají zadní orgán, spinneret, pro výrobu hedvábí.
.