Po nástupu do funkce prezidenta se Jackson při tvorbě politiky nepodřizoval Kongresu a jako první prezident převzal velení s právem veta. Zatímco předchozí prezidenti odmítali pouze návrhy zákonů, které považovali za protiústavní, Jackson vytvořil nový precedens tím, že se perem veta oháněl jako politickou záležitostí.
Stále rozčilen výsledky voleb v roce 1824 věřil, že dá pravomoc volit prezidenta a viceprezidenta americkému lidu tím, že zruší sbor volitelů, což mu vyneslo přezdívku „lidový prezident“. V kampani proti korupci se Jackson stal prvním prezidentem, který ve velkém nahrazoval dosavadní držitele úřadů svými příznivci, což se stalo známým jako „kořistnický systém“.
Druhá banka Spojených států
Ve svém snad největším prezidentském počinu se Jackson zapojil do boje s Druhou bankou Spojených států, teoreticky soukromou společností, která ve skutečnosti sloužila jako vládou sponzorovaný monopol. Jackson banku považoval za zkorumpovanou, elitářskou instituci, která manipulovala s papírovými penězi a měla příliš velkou moc nad ekonomikou. Jeho protikandidát ve volbách v roce 1832 Henry Clay věřil, že banka podporuje silnou ekonomiku. Clay a jeho stoupenci se snažili učinit z banky ústřední téma volební kampaně a prosadili v Kongresu návrh zákona o opětovném pověření této instituce. V červenci 1832 Jackson opětovné pověření vetoval, protože podporovalo „pokrok několika lidí na úkor mnoha“.
Americká veřejnost podpořila prezidentovy názory na tuto otázku a Jackson v roce 1832 vyhrál svou kampaň za znovuzvolení proti Clayovi s 56 % hlasů voličů a téměř pětinásobným počtem hlasů volitelů. Během Jacksonova druhého funkčního období pokusy o znovuzřízení banky ztroskotaly a v roce 1836 byla tato instituce uzavřena.
Jacksonův viceprezident: Calhoun
Dalším politickým protivníkem, kterému Jackson v roce 1832 čelil, byl nepravděpodobný protivník – jeho vlastní viceprezident. Po schválení federálních cel v letech 1828 a 1832, která podle jejich názoru zvýhodňovala severské výrobce na jejich úkor, přijali odpůrci v Jižní Karolíně rezoluci, v níž tato opatření prohlásili za neplatná ve státě, a dokonce pohrozili secesí. Viceprezident Calhoun podporoval princip nullifikace spolu s myšlenkou, že státy mohou vystoupit z Unie.
Ačkoli se Jackson domníval, že cla jsou příliš vysoká, pohrozil, že k prosazení federálního zákona v Jižní Karolíně použije sílu. Calhoun, kterého na kandidátce z roku 1832 již nahradil newyorský Martin Van Buren, bývalý Jacksonův ministr zahraničí, protestoval a 28. prosince 1832 se jako první viceprezident v americké historii vzdal své funkce. Během několika týdnů byl přijat kompromis, který zahrnoval mírné snížení cel spolu s ustanovením, které opravňovalo prezidenta v případě potřeby použít ozbrojené síly k prosazení federálních zákonů. Krize byla zažehnána, ale boj o práva států předznamenal občanskou válku o tři desetiletí později.
Během Jacksonova druhého funkčního období se stal terčem prvního atentátu na prezidenta v americké historii. Když 30. ledna 1835 odcházel ze zádušní mše za jednoho kongresmana uvnitř amerického Kapitolu, vynořil se z davu pomatený malíř pokojů Richard Lawrence a namířil na prezidenta jednorannou zlatou pistoli. Když pistole nevystřelila, vytáhl Lawrence druhou pistoli, která rovněž nevystřelila. Rozzuřený Jackson na střelce zaútočil a udeřil ho holí, zatímco kolemjdoucí pokus o atentát zkrotili. V Anglii narozený Lawrence, který se domníval, že je dědicem britského trůnu a že mu americká vláda dluží obrovské množství peněz, byl shledán nevinným z důvodu nepříčetnosti a do konce života byl zavřen do ústavů.
Kontroversní rozhodnutí
Trail of Tears
Přes svou popularitu a úspěch se Jacksonovo prezidentství neobešlo bez kontroverzí. Jedním z obzvláště znepokojivých aspektů bylo jeho jednání s původními obyvateli Ameriky. Podepsal a realizoval zákon o stěhování indiánů z roku 1830, který mu dal pravomoc uzavírat smlouvy s kmeny, jejichž výsledkem bylo jejich vysídlení na území západně od řeky Mississippi výměnou za domovinu jejich předků.
Jackson také přihlížel tomu, jak Georgia porušila federální smlouvu a zabavila devět milionů akrů na území státu, které byly zaručeny kmeni Čerokíjů. Přestože Nejvyšší soud USA ve dvou případech rozhodl, že Georgia nemá nad kmenovými pozemky žádnou pravomoc, Jackson odmítl tato rozhodnutí vykonat. V důsledku toho prezident zprostředkoval dohodu, podle níž Čerokíové uvolní svou půdu výměnou za území na západ od Arkansasu. Tato dohoda vyústila po skončení Jacksonova prezidentství v „Stezku slz“, nucené stěhování přibližně 15 000 indiánů Čerokíjů na západ, které si vyžádalo životy přibližně 4 000 lidí, kteří zemřeli hladem, vystavením a nemocemi.
Rozhodnutí ve věci Dred Scott
Jackson také nominoval svého příznivce Rogera Taneyho do Nejvyššího soudu USA. Původní nominaci Senát v roce 1835 zamítl, ale když zemřel předseda Nejvyššího soudu John Marshall, Jackson znovu nominoval Taneyho, který byl následně v následujícím roce schválen. Soudce Taney se stal nejznámějším díky nechvalně proslulému rozhodnutí ve věci Dred Scott, které prohlásilo, že Afroameričané nejsou občany Spojených států a jako takoví nemají právní způsobilost k podání žaloby. Rovněž prohlásil, že federální vláda nemůže zakázat otroctví na amerických územích. Během své kariéry soudce Nejvyššího soudu měl Taney přísahat Abrahamu Lincolnovi jako prezidentovi.
Zatímco Jacksonovi příznivci vytvořili Demokratickou stranu, jeho odpůrci se rovněž sdružili v nové politické straně, kterou spojovala antipatie vůči prezidentovi a jeho politice. Strana whigů, která přijala stejný název jako antimonarchisté v Anglii, se zformovala během Jacksonova druhého funkčního období na protest proti tomu, co považovala za autokratickou politiku „krále Andreje I.“.
Strana whigů neuspěla v prezidentských volbách v roce 1836, které vyhrál Martin Van Buren. Jackson však svému nástupci zanechal ekonomiku připravenou ke krachu. „Starý Hickory“ věřil, že papírové peníze nepřinášejí prospěch obyčejným lidem a že umožňují spekulantům nakupovat obrovské plochy půdy a uměle zvyšovat ceny. Protože sám utrpěl finanční ztrátu ze znehodnocených papírových bankovek, vydal Jackson v červenci 1836 Specie Circular, který vyžadoval platbu za veřejnou půdu ve zlatě nebo stříbře. Banky však tuto poptávku nemohly uspokojit. Začaly krachovat a následná panika z roku 1837 zničila ekonomiku během Van Burenova jednoho prezidentského období.